После окончания МГИМО Ильнар Ильбатырович Мирсияпов встал перед непростым выбором – как и где начать свою карьеру. Поначалу он намеревался замахнуться на самые серьёзные планы, выбрал целью попасть в крупнейшую компанию «большой четверки» экономики, сделал несколько шагов в этом направлении, даже прошёл все тесты, но в итоге решает, что ближе ему всё-таки реально работающие системы.
Ильнар устраивается в небольшую нефтяную компанию Татарстана, экспортирующую нефтепродукты, где отрабатывает полтора года. После этого Ильнар работает в компании «Стройнефть», принадлежащую корпорации «Транснефть». В Центре управления проектами «Стройнефти» Мирсияпов Ильнар работал менеджером по бизнес-информации. Ему приходилось отслеживать и перерабатывать огромное количество информации о текущих проектах, заниматься разработкой новой, более эффективной системы сбора информации, позволяющей более чётко видеть недостатки работы компании. За два года работы в «Стройнефти» Ильнар Ильбатырович Мирсияпов получает неоценимый опыт, этот этап, по его словам, стал прекрасной школой для дальнейшего роста.
Далее Мирсияпов Ильнар переходит в структуру Федерального агентства по атомной энергии, работает замом начальника управления делами, являясь там самым молодым сотрудником. Главным в той работе Ильнар считает, что он получил опыт работы антикризисным менеджером. В 2007г. Агентство становится Госкорпорацией «Росатом». Ильнар контактировал и решал вопросы с Росимуществом, Госдумой, продвигал новые законы. Он являлся также руководителем штаба по защите от рейдерских атак, тем самым спасая многие подконтрольные предприятия, выводя их из кризиса.
Спустя некоторое время Мирсияпов Ильнар Ильбатырович становится директором Департамента административного обеспечения корпорации «Атомэнергопром», дочерней структуры ГК «Росатом», напрямую подчиняясь генеральному директору. Далее он переходит в структуру, занимающуюся корпоративным управлением ГК «Росатом». Ильнар работает замом гендиректора, потом за четыре года трижды меняет посты, каждый раз совершая шаг вверх по карьерной лестнице и приобретая огромный опыт.
В 2009г. Ильнар Мирсияпов приглашается на должность советника председателя Правления компании «Интер РАО», а уже через пять месяцев назначается руководителем блока стратегии инвестиций. Проходит полгода, и он становится одним из десяти членов Правления «Интер РАО».
За время работы в компании Ильнар приложил много усилий, чтобы она стала крупнейшим российским холдингом в отрасли электроэнергетики, заняла в ней лидирующую позицию.
На посту члена Правления «Интер РАО» Ильнар трудится и на сегодняшний момент.